“十二五”时期，是我国经济发展方式转变的关键时期，对大幅提高科技创新能力的要求越来越迫切。如何提高政府科研经费的使用效率、更好发挥政府科研经费的引导作用，是我国提高科技创新能力的一个重点任务。

一、政府科研经费投入的评价机制存在的问题

1．缺乏对政府科研计划的宏观评价体系和机制

科技评估已成为世界各国进行科技管理的重要手段。虽然目前我国科技管理相关政府部门针对科技发展情况、科技经费的有关投入及使用情况发表相关的报告，但这种报告并不是基于对我国科技计划进行科学、严谨评估的基础上做出的，行政报告的痕迹浓重，对我国真实科技发展现状的展现、未来趋势的预测说服力不强，也难以得到社会的真正认可。

2．对科研项目的考核、评价制度不完善

目前我国对科研项目的绩效虽然有考核，但评价制度不完善。首先，现有的考核体制，更多地肯定了定量评价的作用，过分注重强调论文（SCI）。科技成果不是一两年就能出来的，很多也不是靠SCI就能弄出来的，特别是一些产业化的项目。所以，这样的评价并不能够反映科学本身的实际情况。其次，虽然对项目（课题）的考核建立了一定的制度、办法和标准。但实际上这些制度、办法和标准对项目单位缺乏约束力，无论项目执行结果如何，均能通过验收。再次，对科研项目的事后跟踪和评价机制缺失。科技活动对社会和经济产生的作用有一定的滞后性和隐蔽性，不是当年投入就能当年见效，从研发到成果、到样品、到商品、到产业化、到获取经济效益是需要周期的，有的需要几年、十几年才见效。目前，各级政府及科研项目主管部门对项目完成后的成果转化情况，以及项目对社会、经济的促进作用进行后续跟踪的工作没有跟上，缺乏应有的后续跟踪和评价机制。

二、完善政府科研经费投入评价机制的建议

1.加快建立我国宏观意义上的科技评估制度。

该评估的主要目标和内容应为国家科技研究和发展的战略和规划、国家科技计划的决策、政府科学政策及科研经费的保障、投入及分配、政府科研投入的使用效果等。

2.针对不同研究类型的项目设置不同的绩效目标，特别是注意区分基础性研究项目和应用技术研究项目。

对于应用技术研究项目，应加强对成果转化情况的考核评价，设定对应的评价指标，真正考核科技项目的成果是否转化为生产力，符合市场需求。

3.建立基于结果管理的项目追踪问效机制。

一是结果评价机制。包括项目目标设定、申请立项时的决策评价、项目阶段性成果评价、项目结题验收、成果应用效果评价、效果与目标对比等6个环节。具体的评估方法应根据科研项目自身特点制定，但要注意改变限期评估的方式，灵活考核项目进展，以最终成果为重点考核对象。

二是目标责任机制。主要考核项目目标和项目负责人之间直接的责任联系。在这方面，可借鉴美国的合同制科研项目的管理方法。美国一些应用性研究，如国防部、国家航天航空局的一些应用课题，具有很强的实用性，有具体的成果目标。对这类科研项目，一般采取政府合同的方式，采用招标方式进行。在管理上，使用美国有关政府采购合同的法律和管理细则。科研合同承担者若不能完成任务，按违反商业合同的有关法律和规章追究其责任。

三是学术信用机制。要对参与国家科学基金申报的负责人建立学术信用档案。学术信用档案既是个人学术水平、学术道德的社会记录，也是进一步申报基金的重要依据。项目的评价结果和目标责任实施情况都将记入项目负责人的学术信用档案。